PyMOL是一款功能卓越的三维分子模型软件,它为用户提供了一个全方位的分子结构数据可视化系统。凭借其先进的集成光源追踪图型技术,PyMOL能够实现3D渲染,使分子模型展现出更加平滑的表面轮廓、逼真的阴影和反射效果。软件支持多种图像文件格式,包括PDB、SDF和电子密度图等,为用户提供了极大的便利。
基于分子结构数据可视化系统,PyMOL能够以三维形式对蛋白质进行细致的分析,包括其相对密度、运动轨迹和表面结构。另外PyMOL支持高分辨率显示,如4K,并提供停靠/撤销停靠及控制面板(包括制作器、意见反馈浏览器、声音在线编辑器)的重新排序功能。触摸板手式操作(捏合放大/缩小,z轴旋转)的使用,使得操作更加直观便捷。软件还配备了用于打开MAE文档、MTZ文档、地形图和轨迹文档的专用提示框,以及全新的APBS软件控制面板。
PyMOL还提供了pymolrc脚本编辑器,并支持语法高亮显示的在线编辑器。另外MPEG-4和GIF影片导出控制面板,以及Excel导出器,让用户能够轻松地将分子模型数据导出为不同格式。通过从文件浏览器直接拖拽文件到PyMOL对话框,用户可以快速打开文件。软件支持组成线/非黏合线和棒/球体等多种输电线和结构表示。
应用特点
提供了强大的绘图工具,帮助用户直观展示分子结构。
支持多种图像文件格式,包括PDB和SDF。
生成的PyMOL结构可以导出为VRML格式。
采用多种图像表示方式,清晰展示分子结构数据信息。
支持自定义颜色、结构标识、目标清晰度、输出和操纵尺寸,以及自动缩放、文字遮盖和鼠标控制等。
如何使用
PyMOL的操作界面直观易用,用户可以轻松上手。以下是一些基本步骤:
打开PyMOL软件。
从文件浏览器拖拽所需的分子结构文件到PyMOL对话框。
使用软件提供的工具和功能进行分子结构的可视化处理。
保存或导出所需的分子结构数据。
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